Bioinformaatika valdkonnas on järjestuste andmebaas bioloogilise andmebaasi tüüp, mis koosneb suurest arvutisse salvestatud arvutipõhiste ("digitaalsete") nukleiinhappejärjestuste, valgujärjestuste või muude polümeerjärjestuste kogumist. Andmebaas UniProt on näide valgujärjestuste andmebaasist.
- Mis on kolm peamist esmase järjestuse andmebaasi??
- Mis on bioloogilise järjestuse andmebaas?
- Mis on järjestus bioinformaatikas?
- Mis on nukleotiidjärjestuste andmebaas?
Mis on kolm peamist esmase järjestuse andmebaasi??
Peamisi järjestuste andmebaase on kolm: Jaapani DNA andmepank (DDBJ) (http: // www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html), EMBL nukleotiidjärjestuse andmebaas (EMBL-pank) (http: // www.ebi.ac.uk/embl/) ja GenBank (http: // www.ncbi.nlm.NIH.gov/genbank/).
Mis on bioloogilise järjestuse andmebaas?
Seda võib mõelda kui mitme pärandiklassi hierarhiat. Üks hierarhia on selle aluseks oleva molekuli tüüp: DNA, RNA või valk. Teine hierarhia on see, kuidas aluseks olevat bioloogilist järjestust kujutab andmestruktuur.
Mis on järjestus bioinformaatikas?
Bioinformaatikas on järjestuste analüüs protsess, mille käigus DNA, RNA või peptiidjärjestus allutatakse mis tahes laiale analüütilisele meetodile, et mõista selle omadusi, funktsiooni, struktuuri või arengut. Kasutatavad meetodid hõlmavad järjestuste joondamist, otsinguid bioloogiliste andmebaaside alusel ja muid.
Mis on nukleotiidjärjestuste andmebaas?
Nukleotiidide andmebaas on järjestuste kogum mitmest allikast, sealhulgas GenBank, RefSeq, TPA ja PDB. Genoomi, geeni ja transkripti järjestuse andmed annavad aluse biomeditsiinilistele uuringutele ja avastustele.