Ncbi lööklaine

1. Milleks kasutatakse NCBI BLASTi??
2. Kas NCBI BLAST on tarkvara?
3. Kuidas leida BLAST?
4. Mis on NCBI GenBank?

Milleks kasutatakse NCBI BLASTi??

Põhiline kohaliku joondamise otsingu tööriist (BLAST) leiab valgu- või nukleotiidjärjestuste kohaliku sarnasuse piirkonnad. Programm võrdleb nukleotiid- või valgujärjestusi andmebaasis olevate järjestustega ja arvutab vastete statistilise olulisuse.

Kas NCBI BLAST on tarkvara?

1990. aastal avaldasid riikliku biotehnoloogia teabekeskuse (NCBI) teadlased uue tarkvarapaketi DNA ja valkude järjestuste kiireks võrdlemiseks [15].

Kuidas leida BLAST?

BLAST jada sarnasuse otsimine

1. Järjestuse sarnasuse otsingu käivitamiseks programmiga Blast valige lehe ülaosas tööriistariba vahekaart 'Blast'.
2. Sisestage vormiväljale kas valgu- või nukleotiidjärjestus või UniProti identifikaator (joonis 37).
3. Klõpsake nuppu 'Run Blast'.

Mis on NCBI GenBank?

GenBank® on terviklik andmebaas, mis sisaldab avalikult kättesaadavaid nukleotiidjärjestusi enam kui 300 000 organismi kohta, mis on nimetatud perekonna tasemel või madalamal, ja mis on saadud peamiselt üksikute laborite ja suuremahuliste sekveneerimisprojektide, sealhulgas kogu genoomi jahipüssi ( ...